Small RNA-Seq

Small RNA-Seq

Los small ARNs no codificantes actúan en el silenciamiento de genes y la regulación post-transcripcional de la expresión génica. Dentro de la fracción de small RNAs se pueden obtener diferentes tipos de RNAs: microRNAs maduros (22nt), piwi-interacting RNAs, reguladores de small RNAs y microRNAs (30nt) dependiendo del organismo.

 

Especificaciones del Servicio

Requerimientos de las muestras:

  • Concentración mínima: 200 ng/uL de RNA
  • Volumen mínimo: 20 uL

Secuenciación:

  • Plataforma Illumina MiSeq o HiSeq, lecturas 36 Single End. Cobertura de 2 a 12 millones de lecturas por muestra.

Análisis Bioinformático

  • Filtrado por calidad y eliminación de restos de adaptadores de las lecturas cortas.
  • Ensamble de novo o alineamiento de lecturas contra genoma de referencia (genoma disponible).
  • Identificación y anotación de ARNs pequeños (miRNA, lncRNA, tRNA, etc.).
  • Análisis expresión diferencial.

Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:

  • Reporte QC muestras
  • Reporte genotecas
  • Reporte secuenciación
  • Raw data
  • Data procesada y anexos
  • Reporte Final

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