Secuenciación de DNA genómico

Secuenciación de DNA genómico

La secuenciación completa del DNA genómico ofrece una visión completa de todo el genoma. Mediante este método, el investigador podrá efectuar la secuenciación de novo del genoma completo de un organismo y/o re-secuenciar un genoma para detectar polimorfismos, variantes de un solo nucleótido, inserciones/deleciones, cambio en el número de copias y variantes estructurales, entre otros.

 

 

Especificaciones del Servicio

Requerimientos de las muestras:

  • Concentración mínima: 8 ng/uL de DNA
  • Volumen mínimo: 20 uL

Secuenciación:

  • Para genomas pequeños: Plataforma Illumina MiSeq, lecturas 150 Pair End
  • Para genomas superiores: Plataforma Illumina HiSeq, lecturas 100/150/250 Pair End

Análisis Bioinformático

  • Control de calidad de las lecturas y limpieza de adaptadores
  • Prueba de ensambladores
  • Enmascaramiento de zonas repetitivas
  • Refinamiento de los ensambles
  • Estadística del ensamble
  • Predicción de genes
  • Anotación de genes codificantes
  • Anotación de genes no codificantes

Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:

  • Reporte QC muestras
  • Reporte genotecas
  • Reporte secuenciación
  • Raw data
  • Data procesada y anexos
  • Reporte Final

 

 


¿Tiene usted alguna otra necesidad que no hayamos cubierto?