Secuenciación de DNA genómico
La secuenciación completa del DNA genómico ofrece una visión completa de todo el genoma. Mediante este método, el investigador podrá efectuar la secuenciación de novo del genoma completo de un organismo y/o re-secuenciar un genoma para detectar polimorfismos, variantes de un solo nucleótido, inserciones/deleciones, cambio en el número de copias y variantes estructurales, entre otros.
Especificaciones del Servicio
Requerimientos de las muestras:
- Concentración mínima: 8 ng/uL de DNA
- Volumen mínimo: 20 uL
Secuenciación:
- Para genomas pequeños: Plataforma Illumina MiSeq, lecturas 150 Pair End
- Para genomas superiores: Plataforma Illumina HiSeq, lecturas 100/150/250 Pair End
Análisis Bioinformático
- Control de calidad de las lecturas y limpieza de adaptadores
- Prueba de ensambladores
- Enmascaramiento de zonas repetitivas
- Refinamiento de los ensambles
- Estadística del ensamble
- Predicción de genes
- Anotación de genes codificantes
- Anotación de genes no codificantes
Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:
- Reporte QC muestras
- Reporte genotecas
- Reporte secuenciación
- Raw data
- Data procesada y anexos
- Reporte Final
¿Tiene usted alguna otra necesidad que no hayamos cubierto?
Servicios
- Secuenciación NGS
- Bioinformática
- Ensamble y Anotación de Genomas
- ddRAD
- Análisis de datos de Genotyping by Sequencing (GBS)
- Análisis de datos de Exomas
- Identificación de variantes de amplicones
- Análisis de datos de RNA-Seq
- Análisis de datos de smRNA
- Análisis de datos de dual RNA-Seq
- Análisis taxonómico de 16S
- Análisis taxonómico de 18S/ITS
- Análisis de datos metagenómicos
- Análisis de datos metatranscriptómicos
- Análisis de datos de Deep-sequencing viral