Metatranscriptoma

Metatranscriptoma

Este servicio permite investigar la expresión génica de una comunidad microbiana compleja, por ejemplo, de muestras ambientales, obteniendo información de los genes que presentan un mayor cambio de niveles de expresión en diferentes condiciones, lo cual podría permitir la identificación de biomarcadores.

Especificaciones del Servicio

Requerimientos de las muestras:

• Concentración mínima: 12 ng/uL de RNA
• Volumen mínimo: 30 uL

Secuenciación:

• Plataforma Illumina HiSeq, lecturas 100 o 150 Pair End, ~ 5Gb por muestra

Análisis Bioinformático

• Filtrado por calidad y eliminación de restos de adaptadores de las lecturas cortas.
• Ensamble de novo.
• Identificación y anotación transcritos codificantes.
• Análisis de expresión diferencial.

Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:

• Reporte QC muestras
• Reporte genotecas
• Reporte secuenciación
• Raw data
• Data procesada y anexos
• Reporte Final