Dual RNA-Seq

Dual RNA-Seq

Este análisis permite obtener información del cambio de la expresión génica en distintas condiciones biológicas de dos organismos en simultáneo. Este servicio se realiza, por ejemplo, en análisis epidemiológicos, donde se desea estudiar cómo afecta el patógeno al huésped desde el punto de vista transcriptómico.

Especificaciones del Servicio

Requerimientos de las muestras:

• Concentración mínima: 12 ng/uL de DNA
• Volumen mínimo: 30 uL

Secuenciación:

• Plataforma Illumina HiSeq, lecturas 100 o 150 Pair End.

Análisis Bioinformático

• Filtrado y trimming lecturas
• Mapeo de lectura contra genoma de referencia
• Cuantificación de los transcritos en bases de datos públicas
• Análisis estadístico con corrección de p-value
• Visualización de datos transcriptómicos
• Test de enriquecimiento ontológico

Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:

• Reporte QC muestras
• Reporte genotecas
• Reporte secuenciación
• Raw data
• Data procesada y anexos
• Reporte Final