Deep Sequencing Viral
Este análisis nos permite detectar y caracterizar virus sin necesidad de detección, aislamiento o previo cultivo. Se puede utilizar para tanto como virus de DNA como de RNA. La clave de estos análisis, tal como lo indica su nombre, es la secuenciación a gran profundidad de las muestras, pudiendo identificar y separar los segmentos genéticos de el o los virus en análisis de la muestra matriz.
Especificaciones del Servicio
Requerimientos de las muestras:
- Concentración mínima: 12 ng/uL de RNA
- Volumen mínimo: 30 uL
Secuenciación:
- Plataforma Illumina HiSeq, lecturas 100 o 150 Pair End.
Análisis Bioinformático
- Filtrado y trimming lecturas
Durante las distintas etapas del servicio, Ud. recibirá:
- Reporte QC muestras
- Reporte genotecas
- Reporte secuenciación
- Raw data
- Data procesada y anexos
- Reporte Final
¿Tiene usted alguna otra necesidad que no hayamos cubierto?
Servicios
- Secuenciación NGS
- Bioinformática
- Ensamble y Anotación de Genomas
- ddRAD
- Análisis de datos de Genotyping by Sequencing (GBS)
- Análisis de datos de Exomas
- Identificación de variantes de amplicones
- Análisis de datos de RNA-Seq
- Análisis de datos de smRNA
- Análisis de datos de dual RNA-Seq
- Análisis taxonómico de 16S
- Análisis taxonómico de 18S/ITS
- Análisis de datos metagenómicos
- Análisis de datos metatranscriptómicos
- Análisis de datos de Deep-sequencing viral